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Biologie Epidémiologie et Analyse de Risque en santé animale

BIOEPAR - http://www6.angers-nantes.inra.fr/bioepar

Evaluation de l'efficacité épidémiologique de stratégies de maîtrise

L’objectif de la modélisation à l’échelle d’une métapopulation est à la fois de permettre de mieux cerner les paramètres clés impliqués dans la diffusion des agents pathogènes entre troupeaux mais également de prédire ex-ante l’efficacité attendue de différentes stratégies de maîtrise des maladies à l’échelle d’une population.

Travaux menés durant la période 2006-2010

Concernant l’approche méthodologie-centrée, les principaux travaux ont concerné :

  • L’estimation de paramètres de transmission par approche bayésienne (appliquée à l’infection par Coxiella burnetii chez les bovins) >>>
  • L’impact des hypothèses markoviennes dans les modèles épidémiologiques >>>
  • L’influence de la fonction de transmission dans les modèles épidémiologiques sur la simulation de la diffusion d’un agent pathogène >>>
  • L’approche de perturbation singulière pour réduire le processus représenté au sein d‘un modèle (appliqué au virus de la diarrhée virale bovine) >>>
  • L’analyse globale de sensibilité pour étudier les sorties fournies par les modèles épidémiologiques (appliqué au virus de la diarrhée virale bovine et la pleuropneumonie contagieuse bovine chez les bovins et le portage de Salmonelles chez le porc) >>>

Concernant l’approche pathogène/système -centrés, les principaux travaux ont concerné :

  • La caractérisation de la structure de contact générée par les mouvements d’animaux (appliqué aux bovins en Bretagne) >>>
  • La propagation du virus de la diarrhée virale bovine dans une métapopulation de troupeaux bovins laitiers
  • L’évaluation quantitative du risque de zoonoses alimentaires appliqué aux abattoirs de porcs >>>
  • L’identification des points clés de contrôle et l’évaluation des stratégies de maîtrise :
    • de l’infection par le virus de la diarrhée virale bovine dans les troupeaux bovins laitiers >>>
    • de l’infection par Mycobacteirum avium paratuberculosis dans les troupeaux bovins laitiers >>>
    • de l’infection des bovins laitiers par Coxiella burnetii >>>

Projets en cours

Les travaux menés au sein de l’équipe MODEC concernant la modélisation à l’échelle de la métapopulation visent à prédire l’efficacité a priori de stratégies de maîtrise à l’échelle d’une population, et plus particulièrement :

  • Le contrôle de l’infection par Salmonella (lien Modec_salmonella) chez le porc à l’échelle de la filière de production (contact : Catherine Belloc) et de l’infection des bovins par Mycobacterium avium paratuberculosis à l’échelle d’une région (Contact : Pauline Ezanno)
  • L’évaluation des différentes stratégies de contrôle vaccinale de l’infection des bovins par le virus de la Fièvre Catarrhale Ovine (Contact : Pauline Ezanno)
  • L’évaluation de différentes stratégies de maîtrise des populations de vecteurs, via l’élaboration d’un modèle de dynamique de population de moustiques intégrant des critères météorologiques et de localisation des gites de vecteurs) adaptable à d’autres populations de vecteurs (Culicoïdes par exemple) (Contact : Pauline Ezanno)