En savoir plus

Résumé de la thèse :

Les échanges d'animaux forment des réseaux de contacts dynamiques et complexes entre troupeaux, mécanisme majeur de propagation d’agents pathogènes. La paratuberculose bovine, due à Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (Map),
est une maladie enzootique largement répandue, transmise entre troupeaux via les échanges commerciaux d’animaux infectés non détectés. Cette maladie au fort impact économique induit pertes de production et réformes précoces. Maladie chronique caractérisée par une longue incubation et dont les tests de dépistage sont peu sensibles, l'observation sur le terrain de la propagation de Map est très difficile et sa gestion reste un défi majeur. L'objectif de cette thèse est de mieux comprendre la propagation de Map à une échelle régionale en utilisant une approche de modélisation, et de comparer des stratégies de maîtrise combinant des mesures de biosécurité interne et externe. Notre avons développé le premier modèle
mécaniste multi-échelles de propagation de Map entre troupeaux bovins laitiers, considérant des dynamiques intra-troupeaux stochastiques (démographie et infection), une transmission indirecte explicite et une hétérogénéité des caractéristiques des troupeaux et des échanges d'animaux définie à partir de données réelles. Nos résultats fournissent les bases essentielles pour une meilleure appréhension de la propagation de Map dans une région endémique, mettant en exergue l’importance des troupeaux pratiquant à la fois l’achat et la vente. Nous avons évalué pour la Bretagne l'efficacité d'un large panel de mesures de maîtrise utilisées seules et combinées, éclairant le rôle clé de la gestion des veaux. L’inférence bayésienne à partir de données épidémiologiques a permis de renseigner le risque d’introduction via les achats d’animaux et le taux de transmission intra-troupeau. L'efficacité de la maîtrise de Map dépendra d'une coordination efficace des interventions et des outils diagnostic disponibles

Mots-clefs :

Modèle épidémiologique, Modélisation multi-échelles, Métapopulation, Réseau de contact, Inférence bayésienne, Paratuberculose, Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis, Stratégies de maîtrise